El servicio de farmacia hospitalaria participa en el proceso de selección de medicamentos, basándose para ello en los perfiles de morbimortalidad de la institución, información científica actualizada, estudios farmacoeconómicos y normativas vigentes.

Por otro lado, participa en los procesos de compra de medicamentos, levantando las necesidades, generando la documentación necesaria para su adquisición y tomando en cuenta siempre los recursos disponibles, normativas vigentes y las necesidades prioritarias de la institución.

Así mismo, el servicio de farmacia hospitalaria, participa en la recepción técnica de medicamentos, aplicando para ello criterios de muestreo y control de calidad, a fin de garantizar que los medicamentos sean efectivos y seguros para los pacientes.

De igual manera, se involucra en la gestión de stock de medicamentos, aplicando para ello criterios de buenas prácticas de almacenamiento con el apoyo de tecnologías de la información que facilitan la gestión de inventarios.